Interoperabilitatea înseamnă capacitatea de a coopera. În cazul blockchain-urilor, interoperabilitatea indică posibilitatea legăturii dintre acestea. Deoarece proiectele blockchain funcționează pe protocoale diferite, comunicarea și cooperarea dintre ele nu este întotdeauna posibilă.
De exemplu, la momentul scrierii acestui articol comunicarea dintre blockchain-urile Bitcoin și Ethereum nu este posibilă, fiindcă este vorba despre blockchain-uri ale căror protocoale nu sunt compatibile.